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Se intendi, usare Bootstrap ed Angular material nello stesso progetto, non credo ci sia nulla di sbagliato. Certo, devi fare attenzione a come li dosi perchè rischi di creare un “mappazzone”, ma effettivamente ci sono dei componenti che ha l’una e l’altro no e viceversa. Personalmente, preferisco puntare su bootstrap perché material tende ad essere troppo invasivo.